Kurikulum Integratif
Perpaduan Kurikulum Nasional + Kurikulum Khas Madrasah menjadi satu kesatuan yang koheren, menghilangkan batas-batas antar mata pelajaran untuk pembelajaran yang lebih fungsional dan menyeluruh. Menghadirkan keseimbangan sikap dan intelektual dari segi akademik dan keagamaan
Tahfizh Alquran
Menjadi Program 'PLUS' dari sekolah/madrasah yang sederajat, karena memiliki target hafalan mencapai 3 Juz beserta 7 Surat Pilihan. Dengan masa 6 tahun, di tahun pertama siswa akan di fokuskan pada Tahsin Alquran, kemudian ditahun berikutnya berfokus pada Ziyadah, Tasmi' & Muraja'ah hafalan Alquran, sampai lulus siswa diharapkan mencapai target yang telah ditetapkan.
Keagamaan
Menyelenggarakan peringatan hari-hari besar islam (PHBI), pelaksanaan pesantren kilat (SANLAT), sampai Malam Bina Iman & Takwa (MABIT) dan bakti sosial (BAKSOS) untuk menumbuhkan nilai-nilai keislaman sejak dini kepada peserta didik.
Ekstrakulikuler
terdapat 6 Ekstrakulikuler di MI Plus Az-Zikra, sebagai wadah pengembangan mnat dan bakat para peserta didik, 1 ekskul yaitu Pramuka, bersifat Wajib (diikuti oleh seluruh peserta didik), 5 lainnya yaitu, Pencak Silat, Panahan, Berkuda, Futsal & Tilawah itu bisa dipilih oleh masing-masing peserta didik sesuai minat & bakatnya.
Outing Class / KunJed
Program yang dirancang untuk menambah wawasan, pengalaman dan pengetahuan peserta didik dengan melakukan pembelajaran diluar sekolah, seperti berkunjung ke lokasi atau lembaga edukatif, sampai berpetualang dan berbaur dengan alam untuk melatih kekompakan, keberanian dan kemandirian para peserta didik
Karakter & Kedisiplinan
Membangun karakter generasi rabbani, dimulai dengan pembiasaan melakukan hal-hal baik disekolah, seperti membiasakan berinfaq setiap jum'at, pemeriksaan kerapihan, kebersihan kelas dan kelengkapan atribut sekolah setiap pekan, memberi apresiasi bagi siswa berprestasi, motivasi serta pendampingan bagi siswa bermasalah.